De Avri-organisatie bestaat, naast de directeur, uit drie afdelingen. De directeur is eindverantwoordelijk voor de bedrijfsvoering en beleidsontwikkeling.
Afdelingen:
- 1. Centrale Staf: adviseert en ondersteunt de directie, de afdeling Bedrijven en de Operationele Dienst.
- 2. Afdeling Bedrijven: richt zich op het vermarkten, bewerken en verwerken van afvalstromen van bedrijven.
- 3. Afdeling Operationele Dienst: zamelt het huishoudelijk afval in van de negen gemeenten.

